孤单和独自在含义和情感上有所不同。
含义上：
孤单是指一个人感到孤独、寂寞，常常与他人或事物失去联系，感到无助和失落。例如，当一个人独自在一个陌生的城市或没有朋友和家人的陪伴时，他可能会感到孤单。
独自则是指一个人独立自主，没有其他人的帮助或参与，自己独立完成某项任务或工作。例如，一个人独自旅行或独自完成一项研究项目时，他可能会感到独自。
情感上：
孤单通常带有一种消极的情感色彩，常常与孤独、寂寞、无助等情感相关联。它可能会让人感到沮丧、失落和悲伤。
独自则通常带有一种积极的情感色彩，展现了一个人的独立和自主性。它可能会让人感到自信、自豪和满足。
总之，孤单和独自在含义和情感上存在明显的区别。孤单通常与孤独、寂寞等消极情感相关联，而独自则通常与独立、自主等积极情感相关联。