首先芝麻种植困难，出苗率低，保苗也不容易。
芝麻是一种喜高温的农作物，其一般都是在气温高、蒸发量大的季节播种，在我们南方这边一般都是在5、6月份的时候才开始播种。而这个期间气温高，虽然利于芝麻出苗，但是芝麻的出苗率并不高，而且出苗以后也不容易保苗。芝麻的苗很小，如果出现大晴天了，或者是暴雨天气，很容易被晒死或者是涝死。在过去种植芝麻，反反复复要进行多次补种、补苗才行，并且还需要细心照看。
其次，芝麻管理很麻烦，采收更麻烦。
芝麻是一种很娇弱的农作物，其对生长环境要求比较高，尤其是对土壤水分反应是非常敏感的。这种农作物既怕渍涝，又不耐长期干旱，因此必须注意灌溉和排水。而芝麻的生育期又正好是在一年中雨水较为充足的时期，因此在种植芝麻的时候，后期管理是丝毫不能松懈的。另外芝麻就算是种植采收了，也全部需要人工，这个同样是一个很费力气的精细活，现在很多的年轻人都没有这个耐心去干了。
最后，芝麻的产量并不高，价格高也不挣钱。
生活中我们常说“芝麻大点的小事情”，可见芝麻是很小的。而也是因为芝麻很小，其产量也不高。一亩地的产量能达到150-200斤，这已经是很不错的了。可是芝麻在市场上的价格也才10元左右，所以一亩地的收入最多才2000元钱。但是从芝麻播种到采收差不多要三个月，除掉肥料、农药、人工成本，根本就不挣钱