发酵饲料可以选择以下几种菌最好：
1. 乳酸菌类：如乳酸杆菌、双歧杆菌等，这类菌可以将饲料中的葡萄糖、糖类等发酵成乳酸，降低饲料的pH值，从而抑制其他有害菌的生长。
2. 纤维素分解菌：如枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌等，这些菌可以降解饲料中的纤维素、半纤维素等难以消化的成分，提高饲料的营养价值。
3. 酵母类：如酿酒酵母、酵母菌等，这类菌可以将饲料中的糖类发酵为酒精和二氧化碳，增加饲料的香味和口感，同时提高饲料的营养价值。
4. 乳酸杆菌和酵母的联合发酵：一些饲料发酵剂中也包含乳酸菌和酵母的联合发酵菌种组合，能够同时降低饲料的pH值和提高营养价值。
不同的菌种组合可以针对不同的饲料种类和生长阶段，具体的组合和使用量需要根据实际情况进行调整和确定。