要在正方形法兰上使用激光切割机割洞，可以按照以下步骤进行操作：
1. 首先，使用CAD软件设计出需要切割的孔的形状和尺寸，并将其保存为激光切割机可以识别的文件格式，例如.dxf或.plt文件。
2. 将正方形法兰放置在激光切割机的切割工作台上，并确保其与切割头之间的距离适当。
3. 打开激光切割机软件，导入保存的切割文件，设置适当的切割参数，例如激光功率、切割速度、工作台移动速度等。
4. 在软件中设置好原点（即切割的起始点），然后启动切割过程。
5. 激光切割机会根据设置的参数和切割文件中的信息，对正方形法兰进行切割，从而形成需要的孔。
6. 完成切割后，检查孔的形状和尺寸是否符合要求，并进行必要的修整或调整。
需要注意的是，在进行激光切割时，要确保安全操作，避免激光辐射对人体造成的伤害。同时，在进行加工前，要对设备进行必要的维护和检查，确保其正常运行。