港澳通行证办理一年一次和多次的区别在于有效期和入境次数限制：
1. 一年一次：这种类型的港澳通行证在发放后的有效期限为一年，持证人只能在有效期内入境港澳一次。一旦入境后，通行证将失效，需要重新办理。
2. 多次：这种类型的港澳通行证在发放后的有效期限内可多次入境港澳，具体入境次数可以根据具体的通行证类型而定。持证人可以在有效期内多次往返港澳。
请注意，无论是一年一次还是多次通行证，持证人在入境港澳时，仍需遵守港澳入境的相关规定和要求。建议您在具体的办理过程中咨询相关机构或官方渠道，以获得准确和最新的信息。