1、标准不同：
正式组织是以效率的逻辑为重要标准。非正式组织是以情感的逻辑为重要标准。
2、组织章程不同：
正式组织是指人们按照一定的规则，为完成某一共同的目标，正式组织起来的人群集合体,是具有一定结构、同一目标和特定功能的行为系统。组织目标是具体的。
非正式组织指以情感、兴趣、爱好和需要为基础，以满足个体的不同需要为纽带，没有正式文件规定的、自发形成的一种开放式的社会组织。非正式组织一般没有明确的组织机构或章程。
3、权威性不同：
正式组织的权力具有强制性服从的特点，并且还有正统性、合法性和稳定性等特点。非正式组织的领袖并不一定具有较高的地位与权力，但他们具有现实的影响力。因为他们能力较强，或是经验较多，或是善于体恤别人。
4、产生过程不同：
非正式组织是指正式组织的成员在长期的工作接触、互动过程中，因社会需求而自发形成的一种与工作相关的非正式人际互动关系。
在正式组织中，其成员之间保持着形式上的协作关系，以完成组织目标为行动的出发点和归宿点。维系正式组织的主要是理性原则。