在《进击的巨人》的故事中，艾伦的头部在巨人嘴巴里的信息并未明确交代三笠是如何得知的。然而，这并不意味着这一情节完全没有线索。我们可以从故事中的一些细节和推断来推测她可能的信息来源：
1. 训练兵团的教官可能是一个关键的角色。他们有追踪巨人的能力，而且一直在寻找艾伦的下落，因此有可能已经知道了艾伦的位置，并把这个消息透露给了三笠。
2. 三笠自己也可能具备一定的推理能力。在动画中，有许多复杂的线索需要观众自行挖掘和理解，所以我们也可以假设三笠通过某种方式得知了这个信息。
3. 此外，其他与墙壁内人类世界有着紧密联系的角色，如莱纳、阿尼等，可能也会有所知晓，并通过某些途径将这一情报传递给三笠。
4. 还有观点提到，艾伦死后脸上的斑纹是摩尔码，翻译过来就是“我在口中”。这可能是一个暗示，让关注艾伦的人能找到他的所在。
5. 另一个值得注意的细节是，当艾伦与三笠道别并告诉三笠在她死后忘记他时，艾伦的眼下和嘴部延伸出了巨人纹路。而在随后的画面中，三笠指出艾伦的头部在嘴里，这与她之前的梦境中嘴部延伸出的纹路一模一样。
总的来说，尽管没有明确的解释，但从故事的内在逻辑和角色之间的关系来看，三笠很可能通过以上几种方式或多种方式的组合得知了艾伦的头部在巨人嘴里的信息。