在AI中输出带图层的PSD文件，可以按照以下步骤进行操作：
打开AI文件，选择“文件”菜单中的“另存为”选项。
在弹出的“另存为”对话框中，选择“Photoshop（.psd）”格式，并设置保存路径和文件名。
在弹出的“Photoshop 选项”对话框中，勾选“保留图层”选项，并根据需要选择其他选项。
点击“确定”按钮，保存PSD文件。
需要注意的是，保存为PSD文件时，AI会将所有图层和对象都转换为智能对象，以便在Photoshop中进行编辑。
因此，在Photoshop中打开PSD文件后，需要双击智能对象以打开AI文件进行编辑。