在农村十字路口进行手动挡车掉头，需要遵循以下步骤：
检查交通规则：确保当前路况允许掉头，避免闯入禁行区域或逆行。
减速：在接近交叉路口时，逐渐降低车速，以便更好地控制车辆。
观察环境：在准备掉头前，仔细观察周围环境，包括交通信号灯、行人、其他车辆以及交叉路口的路况。
寻找合适地点：在十字路口寻找一个合适的地点进行掉头。这通常需要找到一处宽度足够、视线良好的地方，以便掉头时可以观察到交叉路口的来车。
换挡：将车辆挂入一档或二档，准备进行掉头。
倒车：将车辆挂入倒档，慢慢倒车，直至车头对准交叉路口的对面。在倒车过程中，需要密切注意周围环境，确保没有其他车辆或行人干扰。
掉头：当车头对准交叉路口的对面时，迅速将车辆挂入一档或二档，然后加速，使车辆开始掉头。在掉头过程中，保持车速稳定，并确保车辆沿着直线行驶。
观察路况：在车辆完全掉头后，继续观察交叉路口的来车情况，确保安全后，驶离掉头区域。
加速并驶离：在确保安全的情况下，逐渐加速，按照交通规则行驶，离开交叉路口。
请注意，在实际操作过程中，需要根据具体路况和交通规则灵活调整。在驾驶过程中，始终保持警惕，确保自己和他人的安全。