要设置新代系统G54的原点坐标，可以按照以下步骤进行：
1. 首先，将机床调整到工件放置位置，确保机床和工件完全停止，并且工具已经离开。
2. 执行"回参考点"功能，将机床回到参考点（通常是机床坐标系的原点），这将作为参考点。
3. 根据工件的实际要求，将刀具或传感器放置在工件的起始位置上。
4. 运行G代码中的G54指令，将当前位置设置为G54坐标系的原点坐标。例如，使用命令"G54 X0 Y0 Z0"将当前位置设置为G54坐标系的原点。
5. 检查设置是否正确，可以使用G53命令返回到机床坐标系，然后使用G54命令返回到G54坐标系，再次检查当前位置是否准确。
6. 如果需要设置其他坐标系的原点，可以重复以上步骤，使用不同的G代码指令（如G55、G56等）。
请注意，每个工作坐标系都有其各自的原点，设置原点坐标需要谨慎操作，确保准确无误。