饿了么商家关店后仍然会自动上线的原因可能有以下几个可能的解释：
1. 技术问题：饿了么系统可能存在技术故障或bug，导致商家关店后系统没有及时更新状态。这可能是由于系统更新延迟、网络连接问题或其他技术方面的原因导致的。
2. 信息延迟：商家关店的信息可能需要一定时间才能在饿了么平台上更新。因为商家关店的决定通常需要经过一些流程，包括通知平台、下线菜单等。这个过程可能需要一些时间才能完成，而在此期间商家仍然被视为“上线”。
3. 误操作或通知不及时：饿了么商家可能由于误操作或通知不及时而导致商家关店的状态没有及时反馈到平台。商家可能忘记或延迟通知饿了么平台关闭他们的店铺。
无论是哪种原因，当商家关店后仍然自动上线时，商家应及时联系饿了么客服团队，向他们报告并解释该问题。饿了么客服团队将能够帮助商家解决该问题，并确保商家的关店状态能够准确地反映在平台上。同时，商家也应主动进行关店操作，以确保所需的关店步骤已经完成。