如果您在使用亿通行APP乘坐公交时出现了不完整行程的情况，可以按照以下步骤处理：
1. 打开亿通行APP，在首页点击“我的行程”进入行程记录页面。
2. 在行程记录页面中找到不完整的行程记录，点击进入该行程记录的详情页面。
3. 在详情页面中，您可以看到该行程记录的具体信息，包括乘车时间、车次、上下车站点等。
4. 如果您需要补全该行程记录，可以点击“补票”按钮。根据指引完成补票操作即可。
5. 如果您错过了补票时间，系统会在一定时间内自动完成补票操作。如果补票失败，您可以在APP内查看补票记录，并按照指引进行后续操作。
需要注意的是，如果不完整行程的原因是您未及时补票，系统会在一定时间内自动完成补票操作，如果补票失败，您需要按照指引进行后续操作。同时，如果您的问题仍未解决，可以联系亿通行客服寻求帮助。