如果4S店购买的新车被水淹了，应该立即采取以下措施，并尽快联系4S店：
1. 不要继续启动车辆：如果发现汽车被淹，立即停止启动车辆。如果引擎吸入了水，可能会造成进一步的损坏。
2. 断开电池：断开车辆电池，以防止电池短路或其他电路问题。
3. 将车辆拖到干地：尽可能快地将汽车拖到干地上，以免水淹越来越深，造成更严重的损坏。
4. 清除淤泥：清除底盘和所有表面淤泥。淤泥会阻止零件正常工作，并会损坏润滑系统和机械零件。
5. 记录损坏：记录所有损坏及定期时间内发生的特定事件，以便在与保险公司和4S店联系时进行说明。
6. 联系保险公司和4S店：报告事故，让保险公司安排评估和修复工作，并向4S店说明情况，寻求他们的建议和帮助。
如果汽车因水淹造成的损害比较严重，需要进行大量修复，那么建议将汽车交给4S店进行修复。4S店具有更专业的修理设备和技术支持，能够更好地修复车辆，并更好地保证汽车的质量和安全性。