区别主要在于：从属关系不同、规模不同、功能不同。
1、学院包含了系属于多个系的集合是从属关系的区别；
2、学院规模大于系规模，因此二者有区别；
3、系主要承担教学培养，学院的功能是在系的基础上更加广泛，涉及到学科建设等等因此功能不同。
大学院和系的区别
1、定义不同
系，高等学校按照专业性质设置的教学行政组织。
学院（英文名：College、Institute或Academy）主要指门类科目较少、专业性强的高等教育机构。
2、分类不同
按照专业类别，一个高等学校可以分设若干个系，系以下设一个或几个性质相近的专业。