慕云舟和阮棠最终没有在一起。
慕云舟和阮棠之间的感情是复杂而曲折的。
虽然他们之间有着深厚的感情，但是由于各种原因，最终他们没有能够在一起。
这其中的原因可能包括家庭背景、社会压力、个人选择等等。
小说《慕云舟阮棠》的结局并没有明确交代他们的关系如何发展，但是可以推测他们最终没有在一起。
这可能是因为他们面临了太多的困难和阻碍，无法克服。
他们可能选择了各自的道路，或者在某种程度上放弃了彼此。
这个结局也可以理解为作者对于现实生活中复杂感情关系的一种描写。
有时候，即使两个人深爱对方，但是由于各种原因，他们最终无法在一起。
这也反映了现实生活中的复杂性和无法预测性。
总之，慕云舟和阮棠最终没有在一起的结局可能是由于各种原因导致的，这也是作者对于现实生活中感情关系的一种描写。